アタッド正在唤醒一个“可爱”的人偶，并为其命名ゲーザ·ハガナー，并给予他一个任务：对那些被选上的样本进行“血祭”（即屠杀），就像玩有趣的游戏一样。
イングラム对被称为アウレフ不满。被メギロード捕获的“クラス·エヴェッド”也是一个相当不错的“素材”，并且アタッド打算开始正式的“收割”。对于イングラム带过来的新“玩具”，但被イングラム拒绝，イングラム要求亲手进行调整，并且打算让样本们以自己的力量来成长到他要求的能力等级。
地球联邦军极东支部伊豆基地 格纳库
R-3的外部部件已经换装完成了，接下来就等待T-LINK系统的“中核”（指アヤ）恢复。
对于イングラム为什么不彻底破坏R-3，カーク认为他是故意射偏的，为了让アヤ“起爆”发挥出更强的力量而对アヤ进行重创。
伊豆基地 医务室
对于如此残酷的现实，アヤ无法接受，想将其看做是一场梦，但是只是做梦和哭泣是没有办法改变现实的，在エクセレン和リューネ的打气下振作了起来，打算和イングラム摊牌。ラーダ又开始了瑜伽推广……
伊豆基地 司令部
キョウスケ少尉被众人推着当上了战场指挥官，并升任中尉，我军部队里所有曹长级别的驾驶员升任少尉。而后，警报大作，第3防卫线上出现Air
Rogatar部队。但是Air Rogatar从前从来没有对支部的军事基地发动过袭击，那么可以推测Air
Rogatar此次前来的目标若不是伊豆基地，则必是ハガネ与ヒリュウ改。为了确认敌军的动机，我军两战舰出击。
第31话 仮面の下にある顔は
前期败北条件：我军战舰被击沉
前期败北条件：我军战舰被击沉
熟练度条件：7回合内击坠ガルイン
机师
4PP
キョウスケ渐渐意识到了，Air
Rogatar并没有攻击机动基地的样子，那么目标就是ハガネ部队，那么被イングラム称作“样本”也多少可以看到是事实了，只是，到底是什么的样本还是个未知数。
BCD<8机
新的敌增援登场，简直就像是读透了我军一样。这也难怪，毕竟イングラム投敌了嘛，那么这里必须做好敌人还会有新增援入场的准备比较好。
4EP
敌军援军登场，青色的机体给人指挥官机的感觉，但却像无人机一样，感觉不到有人的气息。而后，原教导队成员，现情报部所属的ギリアム少佐也赶来增援。
与ガルイン第一次交手后
ラトゥーニ与ギリアム同时吃了一惊，因为对方的动作实在很熟悉，到底是谁呢
原特殊战技教导队，现在还留在联邦军的只剩ギリアム和カイ了。不过エルザム和ゼンガー现在正以地球圈整体作为优先对象而活动着，迟早会助我军一臂之力。
ダイテツ舰长将ラトウーニ带来后，几人就之前的指挥官机的战斗资料展开了分析。ラトウーニ在School的时候，曾经见到过和该指挥机的战斗风格非常相似的资料，而カイ也突然有了熟识的感觉，而后终于辨认出，这种风格是原特殊战绩教导队队长カーウァイ的。而其实カーウァイ大佐早在几年前就在初代ゲシュペンスト2号机的宇宙实验中连人带机行踪不明。因此有カーウァイ大佐就坐在Air Rogatar的机体上的可能。至于レフィーナ舰长提出的是否イングラム盗用了大佐的数据的假设，如果イングラム要盗用数据的话，相比在2年前就连人带机行踪不明的 人的数据，教导队现在仍然存留的人员的实战经验恐怕更为丰富，那么就没有理由特地去使用已经失踪了数年的大佐的资料。
ダイテツ舰长的假设是Air Rogatar在战力和技术力上都比我们要先进，那么它们需要的很可能就是地球人的战斗数据并将其录入到指挥官机里使用。
ギリアム打算从调查イングラム的过去开始入手，而后这件迷案就转交给了情报部的ギリアム，ダイテツ舰长要求大家在真相判明以前保持低调。